29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4207 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  100 
 
 		 359 aa  745    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  36.02 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  29.16 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  28.81 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  29.78 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  27.73 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  29.38 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  28.81 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  28.37 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  27.82 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  28.9 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  28.13 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  30 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  29.28 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  31.72 
 
 		 330 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  27.32 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  30.3 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  28.57 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  28.31 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  28.21 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  28.68 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  28.21 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  28.68 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  24.79 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  28.99 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  26.59 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  24.23 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  27.94 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  34.15 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>