29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0349 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  100 
 
 		 353 aa  736    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  71.04 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  43.71 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  41.89 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  40.46 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  38.58 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  38.27 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  34.6 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  39.26 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  37.62 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  34.98 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  32.26 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  30.46 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  29.91 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  29.91 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  30.2 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  29.91 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  30.2 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  32.2 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  30.06 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  32.81 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  30.14 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  29.91 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  32.69 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  31.03 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  32.69 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  28.65 
 
 		 359 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  26.62 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  33.6 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>