29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2325 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  95.32 
 
 		 342 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  87.3 
 
 		 341 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  56.8 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  52.12 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  47.06 
 
 		 340 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  49.37 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  42.51 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  42.51 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  42.51 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  42.51 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  42.51 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  43.15 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  42.34 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  40.9 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  38.01 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  40.97 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  40.31 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  39.43 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  38.99 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  39.19 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  38.17 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  38.31 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  38.65 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  36.45 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  35.53 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  29.38 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  26.11 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  45 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>