More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0139 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  75.98 
 
 		 232 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  58.44 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  46.12 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  41.92 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  42.31 
 
 		 433 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  42.74 
 
 		 409 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 		 411 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  38.26 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 420 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  41.36 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  39.74 
 
 		 413 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  39.32 
 
 		 413 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  39.22 
 
 		 410 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  38.72 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  39.38 
 
 		 408 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  37.23 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  40.34 
 
 		 415 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 409 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 		 407 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 415 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 409 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  40.34 
 
 		 415 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  40.34 
 
 		 415 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 		 407 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  38.36 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  39.6 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  35.75 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  37.29 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  38.49 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  37.09 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  35.87 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  38.08 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  35.14 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  33.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.6 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  38.14 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  34.6 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  37.87 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.48 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.75 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  35.96 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  35.42 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  41.61 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  30.74 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  27.38 
 
 		 263 aa  88.2  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  32.34 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  32.77 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  31.22 
 
 		 295 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  32.48 
 
 		 305 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  31.22 
 
 		 295 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  32.78 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 		 296 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  28.18 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  30.8 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  32.78 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24560  dienelactone hydrolase-like enzyme  30.64 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.278572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  30.8 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  30.3 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  29.83 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>