57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2462 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 524 aa  1040    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  50.99 
 
 		 410 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  40.97 
 
 		 411 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  36.34 
 
 		 407 aa  223  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  32.32 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  37.23 
 
 		 350 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.5 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  33.76 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  36.78 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  36.82 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  32.75 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  36.54 
 
 		 562 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  29.98 
 
 		 409 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  28.72 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  28.78 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  31.95 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.5 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 407 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 		 403 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  32.48 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  34.19 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  30.28 
 
 		 414 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 406 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  29.07 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 402 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  26.93 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  31.46 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  27.39 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  29.58 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 399 aa  67  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  32.32 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  32.64 
 
 		 320 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0301  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 167 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  31.71 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 146 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 488 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>