More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1253 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1253  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 353 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  71.64 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0434  3-dehydroquinate synthase  69.23 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1664  3-dehydroquinate synthase  68.24 
 
 		 364 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.825748  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1717  3-dehydroquinate synthase  49.08 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  41.71 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  42.62 
 
 		 370 aa  208  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 365 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  35.57 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  37.2 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  35.41 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  37.74 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.91 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  36.26 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  38.3 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  37.47 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  41.1 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  34.16 
 
 		 364 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  39.16 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  38.56 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  39.1 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  41.05 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  34.07 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  37.87 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  38.22 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  37.77 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  34.25 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  37.4 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.36 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.14 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  37.67 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  42.47 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  31.02 
 
 		 363 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  33.05 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>