79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0227 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  84.31 
 
 
246 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  44.72 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  40.81 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1186  Peptidase M23  44.81 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2350  hypothetical protein  43.75 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  34.19 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  41.59 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  37.17 
 
 
223 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  34.57 
 
 
199 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  43 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  41 
 
 
230 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  35.77 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  34.81 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  39.32 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1880  Peptidase M23  35.66 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  30.07 
 
 
348 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  36.63 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  37.72 
 
 
348 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  33.33 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  40.21 
 
 
204 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  34.91 
 
 
181 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  35.83 
 
 
199 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  31 
 
 
311 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.74 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  36.52 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  31 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  33.93 
 
 
435 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  37 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  35.96 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  26.15 
 
 
306 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  34.75 
 
 
347 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  34.86 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  35.85 
 
 
169 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.76 
 
 
554 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.97 
 
 
420 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  33.96 
 
 
178 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  34.97 
 
 
400 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  31.82 
 
 
293 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  34.97 
 
 
421 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  30.5 
 
 
293 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  34.97 
 
 
421 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.51 
 
 
454 aa  45.4  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  33.33 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  35.92 
 
 
412 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  33.8 
 
 
425 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.64 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  28.63 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  35 
 
 
198 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  35.79 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  30.48 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35 
 
 
447 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  34.91 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  35.79 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  28.93 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  36.27 
 
 
446 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34 
 
 
468 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  32.65 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  34.62 
 
 
390 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  27.01 
 
 
457 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  32.26 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  31.94 
 
 
392 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2125  peptidase M23B  38.33 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.883354  normal  0.328475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  32.14 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  31.53 
 
 
1142 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  60 
 
 
653 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1743  Peptidase M23  32.08 
 
 
646 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  32.65 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  32.14 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.74 
 
 
309 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  33.67 
 
 
299 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  30.4 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.67 
 
 
569 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  34 
 
 
479 aa  42.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  33.67 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.26 
 
 
503 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  34.26 
 
 
449 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  30.89 
 
 
224 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  32.57 
 
 
323 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>