219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0156 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  59.5 
 
 		 1119 aa  1292    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  100 
 
 		 1108 aa  2265    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  35.31 
 
 		 1965 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  34.86 
 
 		 1311 aa  405  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0113  alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 1019 aa  219  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.5746e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  25.03 
 
 		 836 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  36.46 
 
 		 828 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  34.5 
 
 		 785 aa  200  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  33.71 
 
 		 770 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  36.99 
 
 		 801 aa  185  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  34.57 
 
 		 803 aa  178  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  34.16 
 
 		 777 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  36.07 
 
 		 779 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  35.66 
 
 		 845 aa  172  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  33.98 
 
 		 806 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  35.79 
 
 		 821 aa  171  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  32.67 
 
 		 776 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  34.45 
 
 		 779 aa  167  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  32.12 
 
 		 768 aa  166  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  36.21 
 
 		 752 aa  163  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  32.07 
 
 		 825 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 927 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  32.39 
 
 		 792 aa  152  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  34.12 
 
 		 779 aa  151  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 951 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  33.1 
 
 		 743 aa  147  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.37 
 
 		 794 aa  145  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.44 
 
 		 795 aa  141  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  30.12 
 
 		 839 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  33 
 
 		 828 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  24.39 
 
 		 791 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  30.88 
 
 		 799 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  30.51 
 
 		 969 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  32.17 
 
 		 746 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 799 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  26.55 
 
 		 794 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  30.99 
 
 		 798 aa  133  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  30.26 
 
 		 836 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.88 
 
 		 797 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  29.94 
 
 		 783 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  35.27 
 
 		 765 aa  128  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  33.09 
 
 		 791 aa  127  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  35.74 
 
 		 765 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  28.27 
 
 		 1016 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.43 
 
 		 1024 aa  127  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  30.16 
 
 		 816 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  33.7 
 
 		 784 aa  125  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  29.46 
 
 		 821 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  29.43 
 
 		 806 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.26 
 
 		 788 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 944 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  32.04 
 
 		 815 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  32.08 
 
 		 791 aa  121  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  32.08 
 
 		 791 aa  121  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.14 
 
 		 973 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  31.4 
 
 		 789 aa  118  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  29.22 
 
 		 715 aa  118  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 795 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  25.59 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  32.12 
 
 		 795 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  29.11 
 
 		 816 aa  114  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 813 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  29.73 
 
 		 760 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.17 
 
 		 700 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  27.04 
 
 		 1128 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  30.55 
 
 		 790 aa  113  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4624  Alpha-glucosidase  30.1 
 
 		 1025 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.77 
 
 		 788 aa  112  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 784 aa  112  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  31.03 
 
 		 803 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.64 
 
 		 787 aa  111  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.62 
 
 		 762 aa  110  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  23.21 
 
 		 1207 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.02 
 
 		 788 aa  109  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 728 aa  108  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  28.9 
 
 		 911 aa  109  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.13 
 
 		 779 aa  108  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  24.31 
 
 		 681 aa  108  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  30.29 
 
 		 683 aa  108  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  27.5 
 
 		 845 aa  108  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.89 
 
 		 803 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  28.67 
 
 		 761 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  29.34 
 
 		 829 aa  106  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.1 
 
 		 806 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  29.41 
 
 		 803 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 797 aa  105  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.45 
 
 		 821 aa  105  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2697  glycoside hydrolase family 31  31.9 
 
 		 715 aa  105  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246264  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  27.3 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.81 
 
 		 752 aa  103  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 799 aa  103  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  23.74 
 
 		 804 aa  102  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 806 aa  102  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  26.33 
 
 		 840 aa  101  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  27.8 
 
 		 702 aa  100  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  30.04 
 
 		 780 aa  100  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  29.1 
 
 		 806 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  25.33 
 
 		 715 aa  99.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  28.81 
 
 		 661 aa  99.8  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.37 
 
 		 685 aa  98.6  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>