194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2697 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3567  glycoside hydrolase family 31  69.55 
 
 		 710 aa  1056    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2697  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 715 aa  1479    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246264  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  27.96 
 
 		 760 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  25.82 
 
 		 765 aa  191  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 779 aa  190  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.98 
 
 		 828 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  26.11 
 
 		 765 aa  173  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  25.51 
 
 		 770 aa  171  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.88 
 
 		 801 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.34 
 
 		 746 aa  157  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  23.18 
 
 		 779 aa  157  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  23.6 
 
 		 772 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  23.78 
 
 		 772 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  23.78 
 
 		 772 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  23.61 
 
 		 772 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  23.61 
 
 		 772 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  24.19 
 
 		 777 aa  154  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  25.81 
 
 		 780 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  23.03 
 
 		 772 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  25.23 
 
 		 821 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  25.56 
 
 		 804 aa  151  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  24.18 
 
 		 749 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  23.59 
 
 		 681 aa  150  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  21.97 
 
 		 757 aa  150  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  23.25 
 
 		 772 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23.43 
 
 		 772 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  24.88 
 
 		 780 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  23.08 
 
 		 772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  23.25 
 
 		 772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  23.08 
 
 		 772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  23.25 
 
 		 772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  23.25 
 
 		 772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.96 
 
 		 764 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  24.83 
 
 		 775 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  24.28 
 
 		 763 aa  147  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.78 
 
 		 764 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  24.11 
 
 		 774 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.83 
 
 		 779 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  23.39 
 
 		 775 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  23.2 
 
 		 770 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  22.9 
 
 		 772 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.38 
 
 		 779 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 799 aa  141  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  27.47 
 
 		 951 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25.58 
 
 		 776 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  23.18 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  23.52 
 
 		 823 aa  138  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.3 
 
 		 772 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  26.41 
 
 		 828 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  24.23 
 
 		 797 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  24.13 
 
 		 775 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  26.31 
 
 		 803 aa  134  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  24.34 
 
 		 836 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  23.68 
 
 		 785 aa  134  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  24.43 
 
 		 783 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  23.89 
 
 		 760 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  23.37 
 
 		 771 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 		 695 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.58 
 
 		 768 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  23.18 
 
 		 766 aa  127  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 777 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  23.41 
 
 		 799 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  22.48 
 
 		 794 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  23.2 
 
 		 712 aa  124  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  23.3 
 
 		 795 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  22.35 
 
 		 760 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  24.67 
 
 		 784 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  24.63 
 
 		 825 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  23.4 
 
 		 973 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  24.95 
 
 		 840 aa  117  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  24.56 
 
 		 845 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 		 795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.36 
 
 		 806 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  24.3 
 
 		 795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.62 
 
 		 752 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  22.77 
 
 		 794 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  22.63 
 
 		 803 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  23.99 
 
 		 806 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  22.01 
 
 		 787 aa  114  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  22.45 
 
 		 789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  22.49 
 
 		 803 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  23.02 
 
 		 791 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  23.02 
 
 		 791 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 944 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 813 aa  111  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  22.84 
 
 		 743 aa  111  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  22.49 
 
 		 1024 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  23.89 
 
 		 836 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  21.63 
 
 		 752 aa  109  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 799 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  23.53 
 
 		 839 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  24.14 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  24.15 
 
 		 803 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  21.82 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  21.82 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  22.11 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  31.9 
 
 		 1108 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  23.08 
 
 		 788 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>