More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1776 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  100 
 
 
434 aa  870    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  36.05 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  35.96 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  33.73 
 
 
435 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  33.41 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  34.41 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  34.19 
 
 
441 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  30.54 
 
 
433 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  31.89 
 
 
453 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  30.21 
 
 
433 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  31.02 
 
 
448 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  31.09 
 
 
448 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  34 
 
 
457 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  35.32 
 
 
457 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  33.56 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  34.83 
 
 
457 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  32.27 
 
 
456 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
456 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  33.16 
 
 
431 aa  186  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  32.82 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  31.14 
 
 
453 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  32.55 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  26.82 
 
 
375 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  28.57 
 
 
411 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.94 
 
 
404 aa  106  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  44.44 
 
 
413 aa  106  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  44.44 
 
 
306 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  43.69 
 
 
400 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  40.88 
 
 
312 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  50.52 
 
 
474 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  51.55 
 
 
503 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.37 
 
 
286 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  49.48 
 
 
475 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.45 
 
 
377 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  30.29 
 
 
268 aa  103  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  47.47 
 
 
475 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.97 
 
 
372 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  47.47 
 
 
473 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  39.53 
 
 
367 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  48.57 
 
 
379 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  40.74 
 
 
313 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  46.39 
 
 
480 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  46.46 
 
 
473 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  42 
 
 
300 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  39.13 
 
 
294 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.5 
 
 
285 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  46.46 
 
 
472 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.52 
 
 
517 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  46.46 
 
 
475 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  41.9 
 
 
404 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  41.53 
 
 
448 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  45.63 
 
 
455 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.66 
 
 
455 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.45 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  36.42 
 
 
285 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  42.72 
 
 
454 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  50.52 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.86 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  40.17 
 
 
266 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  47.87 
 
 
305 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.43 
 
 
301 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  45.36 
 
 
468 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43 
 
 
430 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.67 
 
 
293 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.44 
 
 
309 aa  97.8  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  37.12 
 
 
318 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  44.66 
 
 
305 aa  97.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  37.12 
 
 
319 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  37.12 
 
 
321 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  45.36 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.63 
 
 
314 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.94 
 
 
398 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41.03 
 
 
273 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  48.42 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  46.81 
 
 
305 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  44 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44.21 
 
 
303 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  42.86 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  29.96 
 
 
255 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.74 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  39.67 
 
 
298 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.04 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.66 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.74 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.84 
 
 
301 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  39.32 
 
 
244 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  42 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  47.87 
 
 
498 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.2 
 
 
300 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  38.66 
 
 
283 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.14 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  42.24 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  38.14 
 
 
469 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  46.32 
 
 
300 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.42 
 
 
375 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  38.33 
 
 
482 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.16 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 
386 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.4 
 
 
238 aa  93.6  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>