83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1570 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  100 
 
 		 115 aa  239  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  38.68 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  38.68 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  35.83 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  46.24 
 
 		 266 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  36.79 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.63 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  33.59 
 
 		 183 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  32.54 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.48 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  40.22 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  33.59 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  33.04 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  40.91 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.47 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  34.95 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  30.77 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.34 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  34.88 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  36.36 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  31.73 
 
 		 346 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.09 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.17 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.43 
 
 		 244 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  38.32 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  38.32 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  25.47 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  37.74 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  37.74 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  25 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.08 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.7 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  31.2 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.58 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  34.41 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 382 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.55 
 
 		 148 aa  47.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 324 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 293 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  33.33 
 
 		 260 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  32.38 
 
 		 311 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  32.67 
 
 		 276 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  33.7 
 
 		 351 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  27.17 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.07 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  24.73 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  31.43 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  34.38 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  33.68 
 
 		 282 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  30.39 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  26.44 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  27.66 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.67 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.07 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  29.66 
 
 		 372 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  27.37 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.37 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.2 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  46.15 
 
 		 301 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.39 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  31.46 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.64 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  30.77 
 
 		 218 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  29.82 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  28.28 
 
 		 221 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  23.36 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  32.47 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.75 
 
 		 175 aa  42.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.28 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  26.67 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.75 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  31.19 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  28.57 
 
 		 443 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  31.37 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  27.72 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  31.07 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  33.66 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>