More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0269 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  68.46 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  68.46 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.38 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.52 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  23.25 
 
 		 290 aa  85.1  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.47 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  22.4 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.01 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  37.38 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.23 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  23.91 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  31.3 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  20.96 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  32.5 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.89 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  31.3 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.29 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  22.62 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  23.26 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  22.57 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  30.43 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  25 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  32.56 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  23.46 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  23.5 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  29.37 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  24.24 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  29.37 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.37 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  21.82 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  22.15 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  21.57 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  22.88 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  26.86 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  21.57 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>