288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0382 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 351 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.69 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.91 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  34.48 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.86 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  34.07 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.83 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  33.05 
 
 		 339 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  34.25 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  34.25 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  32.23 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.82 
 
 		 326 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  28.13 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  22.87 
 
 		 307 aa  86.7  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 312 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.48 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  32.21 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  25.45 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  32.85 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.83 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.65 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  32.16 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  30.21 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.31 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  24.23 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  24.23 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  22.52 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.07 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.77 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.99 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.07 
 
 		 627 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.61 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.87 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>