257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3405 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  25.98 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  25.85 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  23.59 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  24.75 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  24.75 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  26.3 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  23.32 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  39.32 
 
 		 205 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  24.62 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 436 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  25.07 
 
 		 427 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  24.24 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  32.47 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  24.52 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.77 
 
 		 178 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  24.44 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.82 
 
 		 152 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  34.01 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 189 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  38.66 
 
 		 153 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  34.02 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  34.19 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  24.28 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.9 
 
 		 187 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.9 
 
 		 178 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.45 
 
 		 195 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 216 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.45 
 
 		 196 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  29.36 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 186 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  36.61 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  38.39 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  37.01 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  27.72 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  31.93 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.67 
 
 		 205 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 213 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 270 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  36.61 
 
 		 196 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  32.19 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.96 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.03 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.05 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.05 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34.21 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  37.39 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  33.59 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  34.68 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  35.4 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  36.44 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.03 
 
 		 211 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 869 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.46 
 
 		 193 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  32.2 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.36 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.56 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  24.23 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 201 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  35.25 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.23 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>