More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0659 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  100 
 
 
628 aa  1236    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  79.93 
 
 
636 aa  918    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  81.07 
 
 
604 aa  911    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  50.24 
 
 
698 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  43.5 
 
 
654 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  44.75 
 
 
635 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  49.7 
 
 
509 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
652 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
624 aa  306  8.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
626 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
642 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  44.2 
 
 
476 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
686 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  35.63 
 
 
673 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  42.13 
 
 
512 aa  276  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.38 
 
 
630 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.43 
 
 
573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  42.59 
 
 
464 aa  270  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  32.09 
 
 
606 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  42.32 
 
 
464 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  42.32 
 
 
417 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  37 
 
 
475 aa  267  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
664 aa  264  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  41.73 
 
 
612 aa  264  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  34.05 
 
 
664 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
683 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 
632 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 
615 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
848 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  39.04 
 
 
492 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 
532 aa  252  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
678 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
537 aa  247  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 
678 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.22 
 
 
656 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  35.63 
 
 
616 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  40.63 
 
 
656 aa  230  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
614 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 
596 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
450 aa  151  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
465 aa  150  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
420 aa  143  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
461 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  36.99 
 
 
219 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  37.62 
 
 
216 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.07 
 
 
644 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
475 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
475 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
433 aa  107  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
395 aa  105  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
471 aa  104  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.65 
 
 
433 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
433 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25.54 
 
 
433 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.85 
 
 
433 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.85 
 
 
433 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.54 
 
 
433 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  25.85 
 
 
433 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
549 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
473 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
431 aa  99.4  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
483 aa  98.2  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
393 aa  96.3  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  28.36 
 
 
458 aa  94.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.7 
 
 
633 aa  95.1  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
468 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
789 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
789 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
789 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
476 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
546 aa  90.9  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.04 
 
 
662 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.8 
 
 
520 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
502 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
505 aa  89  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.04 
 
 
505 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  32.4 
 
 
443 aa  88.6  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
399 aa  88.2  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  27.96 
 
 
469 aa  87.4  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
520 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
520 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
501 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
509 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
501 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
492 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
752 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.25 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
586 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  28.3 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  27.35 
 
 
863 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>