More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2505 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  634    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 158 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  36.73 
 
 		 158 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 159 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 158 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 159 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  34.9 
 
 		 167 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 157 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 168 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  33.1 
 
 		 181 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  32.39 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  30.99 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  30.82 
 
 		 157 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  29.58 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 127 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  29.58 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  32.8 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  29.77 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1057 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  31.29 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 127 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  31.36 
 
 		 122 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.75 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.75 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 811 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  31.45 
 
 		 1286 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.75 
 
 		 957 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 869 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  35.94 
 
 		 123 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 127 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.13 
 
 		 1956 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1196 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 781 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  31.55 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1202 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 1245 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  30 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  30 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 2539 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  30 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.78 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  33.06 
 
 		 2092 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1316 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  30.4 
 
 		 942 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.51 
 
 		 1989 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 1646 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 1647 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  32.19 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1240 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 1646 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.88 
 
 		 928 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.07 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  31.3 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  34.82 
 
 		 2048 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  30 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 1203 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  29.92 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.23 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2149  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.02 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.93 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 		 1834 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>