More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2193 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  100 
 
 		 452 aa  930    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  58.74 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  58.24 
 
 		 461 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  56.67 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  56.5 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  53.57 
 
 		 455 aa  474  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  56.82 
 
 		 455 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  56.29 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  56.82 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  52.89 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  54.81 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  55.26 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  55.26 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  52.24 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.62 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  32.44 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  37.29 
 
 		 543 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  28.47 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  32.47 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  33.78 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.06 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  33.78 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.01 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  33.11 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  33.11 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.11 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  33.78 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  30.12 
 
 		 438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  36.12 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  30.91 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.69 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  35.36 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.67 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.66 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  33.63 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.92 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.58 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  28.54 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  36.67 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  34.42 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  29.76 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  33.99 
 
 		 610 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  35.13 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  32.11 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  34.2 
 
 		 588 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  33.11 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  30.95 
 
 		 576 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  35.02 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  31.86 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  33.11 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.14 
 
 		 599 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.21 
 
 		 555 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  34.51 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.61 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  32.47 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  33.44 
 
 		 476 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  33.56 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  32.38 
 
 		 566 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  28.82 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.85 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 		 583 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.38 
 
 		 552 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  32.54 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 		 475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  32.32 
 
 		 557 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.75 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  32.54 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.21 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  28.85 
 
 		 438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  29.89 
 
 		 565 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.44 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  26.71 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  31.29 
 
 		 451 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  31.29 
 
 		 451 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.13 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  29.41 
 
 		 582 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  29.79 
 
 		 556 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.99 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  33.87 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  26.55 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.54 
 
 		 559 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.94 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  32.45 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.99 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  33.55 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.74 
 
 		 565 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.74 
 
 		 565 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  33.58 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  29.05 
 
 		 514 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.17 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  30.56 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  30.48 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  30.77 
 
 		 550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.8 
 
 		 557 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.13 
 
 		 558 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  34.89 
 
 		 613 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.53 
 
 		 549 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  31.46 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>