More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0799 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1073    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  47.71 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  49.72 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  48.82 
 
 		 546 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  48.13 
 
 		 547 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  46.94 
 
 		 547 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  49.51 
 
 		 547 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  47.39 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  48.39 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  47.66 
 
 		 533 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  47.68 
 
 		 538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  45.53 
 
 		 532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  44.61 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  46.02 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 		 529 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.61 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  44.17 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  47.58 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  45.63 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.22 
 
 		 563 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 529 aa  445  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  45.85 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  45.85 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  45.85 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  45.85 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  45.65 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  45.85 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  45.89 
 
 		 530 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  42.4 
 
 		 532 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 		 537 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  43.98 
 
 		 543 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  43.79 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  43.79 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  43.79 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  42.97 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  43.58 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  39.46 
 
 		 522 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 521 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  37.76 
 
 		 522 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 522 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 522 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  38.88 
 
 		 536 aa  343  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  36.91 
 
 		 531 aa  336  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  36.83 
 
 		 536 aa  317  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  36.64 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  35.63 
 
 		 536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  35.73 
 
 		 531 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  35.4 
 
 		 531 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 538 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  37.88 
 
 		 534 aa  300  6e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 556 aa  293  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  35.6 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 528 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 536 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 		 536 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 		 528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 525 aa  183  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.33 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.88 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.88 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.48 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.18 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.28 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 534 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.95 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.96 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>