More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2477 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 118 aa  236  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  93.22 
 
 		 123 aa  222  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  72.48 
 
 		 109 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  79.38 
 
 		 110 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  70.59 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  70.48 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  67.33 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.65 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  70.59 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.63 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64.29 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  69.39 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  65.98 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.4 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  62.38 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  67.35 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  60.78 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  62.24 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.4 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  60.4 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  60.4 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  60.4 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.86 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  62.89 
 
 		 275 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  70.3 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165068 
 
 
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NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  63.27 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  69.31 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  70.1 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  65.14 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  68.32 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  68.32 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  68.32 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  58.42 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
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NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  66.34 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.27 
 
 		 299 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  58.16 
 
 		 295 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
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NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.54 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  60.23 
 
 		 261 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.79 
 
 		 260 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  48.96 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.04 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  46.32 
 
 		 268 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  57.58 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
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NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  39 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  38.05 
 
 		 298 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.75 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  48 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.39 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  41.24 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.56 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.34 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  40.21 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  40.21 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  38.54 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  42.39 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  42.86 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.31 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 		 363 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.01 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.05 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.56 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1069  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00016362  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.53 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  43.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.68 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.68 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  33.68 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  38.78 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.16 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  41.24 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
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NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
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