More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2513 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 405 aa  815    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  74.07 
 
 		 406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  74.07 
 
 		 406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  74.32 
 
 		 402 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  70.71 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  57.32 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  57.32 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  61.27 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  41.99 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  34.11 
 
 		 326 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  34.75 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  38.3 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  35.9 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.72 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  34.36 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  32.77 
 
 		 325 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  33.98 
 
 		 326 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  34.24 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  34.5 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  34.24 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  34.85 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  43.04 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.99 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  32.91 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  36.95 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  33.53 
 
 		 524 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  33.22 
 
 		 439 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  30.22 
 
 		 824 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.1 
 
 		 803 aa  104  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 789 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 		 853 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  33.7 
 
 		 826 aa  103  6e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 813 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  30.26 
 
 		 783 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  32.79 
 
 		 792 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 		 856 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 898 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  33.74 
 
 		 786 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  33.76 
 
 		 820 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 807 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  30.36 
 
 		 805 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  34.57 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 783 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 825 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  33.67 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 		 880 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 800 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 815 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  31.9 
 
 		 207 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  32 
 
 		 835 aa  100  4e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 800 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 798 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36 
 
 		 772 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 799 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 		 812 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  30.05 
 
 		 836 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 		 812 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  35.37 
 
 		 528 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  34.44 
 
 		 812 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 791 aa  99.8  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  26.92 
 
 		 794 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  31.49 
 
 		 810 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  33.94 
 
 		 790 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  31.15 
 
 		 800 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 		 837 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 805 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  35.33 
 
 		 803 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 808 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  32.03 
 
 		 809 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 835 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 805 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  29.55 
 
 		 794 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  32.03 
 
 		 825 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 805 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 		 804 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 806 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  30.91 
 
 		 814 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 806 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  33.56 
 
 		 799 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  33.56 
 
 		 799 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  33.99 
 
 		 775 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 805 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 805 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  33.99 
 
 		 800 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 807 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  32.03 
 
 		 840 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  32.32 
 
 		 806 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 808 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  33.11 
 
 		 809 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  32.39 
 
 		 816 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>