More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3889 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 624 aa  1276    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  45.11 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  39.09 
 
 		 597 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  37.39 
 
 		 576 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  39.57 
 
 		 577 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  32.74 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  33.74 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  34.64 
 
 		 547 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  35.45 
 
 		 555 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  33.98 
 
 		 555 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  33.99 
 
 		 554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 542 aa  243  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  32.73 
 
 		 547 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 547 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  28.5 
 
 		 625 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.36 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.53 
 
 		 575 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  29.31 
 
 		 586 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  37.9 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  38.31 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  27.31 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 536 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 536 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 536 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  26.64 
 
 		 584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.29 
 
 		 543 aa  157  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.78 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 564 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.78 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  36.48 
 
 		 525 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.29 
 
 		 581 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 530 aa  150  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  26.97 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.49 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3968  amidohydrolase 3  24.42 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  27.17 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.44 
 
 		 604 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.34 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  25.56 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  25.84 
 
 		 548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  25.84 
 
 		 581 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  26.29 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.64 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.29 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 543 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.96 
 
 		 544 aa  127  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.35 
 
 		 522 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.02 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  25.95 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  26.87 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  26.17 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 544 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.09 
 
 		 556 aa  124  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.58 
 
 		 549 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  25.18 
 
 		 547 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 532 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  24.53 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  26.22 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  24.46 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.57 
 
 		 541 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  25.57 
 
 		 569 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.76 
 
 		 560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  24.65 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  24.65 
 
 		 592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  24.29 
 
 		 556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  25.64 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  25.3 
 
 		 585 aa  114  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  34.67 
 
 		 648 aa  113  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 552 aa  114  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  25.39 
 
 		 563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  22.6 
 
 		 596 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.17 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  23.65 
 
 		 560 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.57 
 
 		 543 aa  110  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.2 
 
 		 539 aa  110  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  25.34 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  26.48 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  24.11 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  25.31 
 
 		 580 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 535 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 539 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  25.3 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.38 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 583 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 583 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 583 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>