More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1952 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  92.74 
 
 		 234 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1851  ABC transporter related  92.31 
 
 		 234 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0531443  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  86.32 
 
 		 234 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1661  ABC transporter related  85.04 
 
 		 234 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  73.08 
 
 		 235 aa  358  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  73.5 
 
 		 235 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  74.36 
 
 		 235 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.43 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.71 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.15 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  51.93 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  50.64 
 
 		 258 aa  244  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  48.93 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50.85 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.36 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  50.21 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.5 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.5 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  49.79 
 
 		 265 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.5 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.36 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  49.79 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  50.85 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.36 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.64 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.78 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  50.21 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  49.79 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  51.28 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  49.79 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.93 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  48.07 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.21 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.64 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  48.93 
 
 		 258 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 237 aa  228  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>