245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0715 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 587 aa  1106    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  63.1 
 
 		 588 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  65.87 
 
 		 588 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  67.46 
 
 		 585 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  36.31 
 
 		 727 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 		 623 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  36.5 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  30.43 
 
 		 622 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  29.75 
 
 		 619 aa  161  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  32.02 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  33.55 
 
 		 613 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  35.28 
 
 		 623 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 704 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.06 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  39.09 
 
 		 503 aa  143  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 588 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  29.07 
 
 		 618 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  32.09 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 		 623 aa  127  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 		 487 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  24.3 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  32.62 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  30.29 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 481 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  32.98 
 
 		 632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  31.74 
 
 		 632 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  31.74 
 
 		 632 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  31.7 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  28.41 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 478 aa  104  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 		 548 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.62 
 
 		 847 aa  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  21.36 
 
 		 637 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  27.05 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.09 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  31.29 
 
 		 623 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 		 476 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  26.95 
 
 		 858 aa  99.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.95 
 
 		 858 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 		 482 aa  98.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  29.43 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  20.94 
 
 		 627 aa  97.4  6e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 		 483 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  25.97 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.45 
 
 		 566 aa  96.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  29.65 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 		 464 aa  94.7  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 		 683 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  29.94 
 
 		 487 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 		 690 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.66 
 
 		 547 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.66 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.16 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.16 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.85 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.66 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.66 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.89 
 
 		 489 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.76 
 
 		 846 aa  91.3  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 		 818 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 		 658 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  25.46 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 		 640 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 		 453 aa  87.4  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 		 657 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  22.43 
 
 		 623 aa  87  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  24.48 
 
 		 920 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  27.2 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.01 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  22.03 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 		 599 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  22.62 
 
 		 583 aa  84  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  29.24 
 
 		 698 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.27 
 
 		 644 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 		 560 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.19 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  24.63 
 
 		 665 aa  81.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  26.56 
 
 		 631 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  26.42 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  25.99 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  23.15 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  27.5 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>