More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3926 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  100 
 
 		 442 aa  895    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  89.37 
 
 		 442 aa  796    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  48.72 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  52.72 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  49.18 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  45.85 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  47.63 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  47.93 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  45.07 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  46.79 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  45.88 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  47.24 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  47.2 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  46.35 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  42.35 
 
 		 452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  46.56 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  42.99 
 
 		 476 aa  342  5.999999999999999e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  41.84 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  44.03 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  44.7 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  44.07 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  40.62 
 
 		 448 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  45.31 
 
 		 448 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 427 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  42.96 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  43.17 
 
 		 430 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  42.96 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.93 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  39.63 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  41.83 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  41.83 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  38.55 
 
 		 479 aa  326  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  38.27 
 
 		 454 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  38.27 
 
 		 454 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  42.45 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 426 aa  325  9e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  44.58 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  38.55 
 
 		 454 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 426 aa  325  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  38.72 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  41.87 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  38.5 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  42.59 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  38.5 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  38.5 
 
 		 454 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  38.5 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  40.48 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  38.32 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  42.32 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.02 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  41.39 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  41.87 
 
 		 426 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  41.75 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  41.77 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  41.51 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  41.27 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  40.38 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  41.27 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  42.42 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  42.23 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 		 425 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.14 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.14 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  41.94 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  39.47 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  41.94 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  41.39 
 
 		 426 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  38.37 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  39.59 
 
 		 446 aa  305  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  41.23 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  40.27 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  41.15 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  40.52 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  40.52 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  40.52 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  40.52 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  38.72 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  42.11 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  40.52 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  40.71 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  39.52 
 
 		 421 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>