123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3156 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1032 aa  857    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  37.02 
 
 		 1048 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  44.53 
 
 		 1043 aa  910    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  41.87 
 
 		 1021 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  46 
 
 		 1063 aa  957    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  100 
 
 		 1060 aa  2169    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.1 
 
 		 931 aa  763    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 1082 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 999 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  42.71 
 
 		 1078 aa  872    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  47.43 
 
 		 1044 aa  950    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 1060 aa  849    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1054 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.8 
 
 		 1041 aa  527  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1075 aa  513  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  33.3 
 
 		 1147 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1090 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  29.93 
 
 		 1084 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 983 aa  327  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  29.57 
 
 		 952 aa  274  8.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1220 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.81 
 
 		 681 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.11 
 
 		 912 aa  146  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  23.8 
 
 		 1083 aa  145  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.86 
 
 		 652 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1117 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.75 
 
 		 630 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.19 
 
 		 694 aa  105  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.27 
 
 		 597 aa  91.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  22.79 
 
 		 1750 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  23.97 
 
 		 876 aa  89.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1321 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.98 
 
 		 608 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  25.73 
 
 		 1904 aa  68.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  26.02 
 
 		 357 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25.47 
 
 		 368 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 357 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 357 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  25.61 
 
 		 357 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  25.61 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  25.96 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  25.96 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  25.47 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.86 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.86 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  25.2 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  27.88 
 
 		 388 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  27.88 
 
 		 388 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  26.85 
 
 		 385 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  25 
 
 		 382 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  25.46 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  26.46 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  25.96 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.16 
 
 		 361 aa  60.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.03 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  25.23 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  25.7 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  21.69 
 
 		 931 aa  58.9  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  26.07 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  24.79 
 
 		 780 aa  58.9  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  26.83 
 
 		 873 aa  58.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.58 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.34 
 
 		 909 aa  57  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  22.82 
 
 		 931 aa  57.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  25 
 
 		 934 aa  56.6  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  22.54 
 
 		 369 aa  56.2  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.35 
 
 		 361 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  25.23 
 
 		 382 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.45 
 
 		 363 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.66 
 
 		 371 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  31.89 
 
 		 978 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  25.12 
 
 		 365 aa  55.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  26.37 
 
 		 365 aa  55.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  24.66 
 
 		 367 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  26.51 
 
 		 361 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  26.51 
 
 		 361 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.43 
 
 		 359 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  22.89 
 
 		 1305 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 757 aa  52.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  24.66 
 
 		 362 aa  52.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 371 aa  52  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 357 aa  51.6  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.11 
 
 		 393 aa  51.6  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 350 aa  51.6  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  22.36 
 
 		 357 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  27.11 
 
 		 361 aa  51.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  28.29 
 
 		 913 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  26.14 
 
 		 935 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.69 
 
 		 357 aa  48.5  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.9 
 
 		 842 aa  48.5  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.58 
 
 		 357 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>