230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1355 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1355  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 317 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3562  GntR family transcriptional regulator  80 
 
 		 319 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  27.52 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3158  regulatory protein GntR, HTH  27.61 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  43.24 
 
 		 471 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 128 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.65 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  39.02 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 126 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 129 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  49.02 
 
 		 159 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  34.45 
 
 		 125 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 125 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  23.3 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  23.3 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  48.94 
 
 		 156 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 139 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 139 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  39.02 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 133 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 130 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  50 
 
 		 478 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 129 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2105  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  40 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.158429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  42.31 
 
 		 75 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  35.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  52.17 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.96 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 126 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.62 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.62 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.62 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 470 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 125 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 120 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 128 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  43.75 
 
 		 121 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  38.71 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  33.64 
 
 		 123 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  31.18 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  24.35 
 
 		 230 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  38.46 
 
 		 115 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  53.49 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 480 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 248 aa  45.8  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.78 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 116 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 478 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2856  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  37.5 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3642  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  43.86 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 485 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  39.58 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6369  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.972084  normal  0.74852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  35.29 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  40.68 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>