239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3158 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3158  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1355  regulatory protein GntR, HTH  27.61 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  45.07 
 
 		 75 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3562  GntR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  32.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 128 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 464 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  31.13 
 
 		 126 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.06 
 
 		 593 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 463 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 128 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 466 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  29.66 
 
 		 156 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 75 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 233 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.8 
 
 		 465 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  36.99 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 125 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 482 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  34.78 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.54 
 
 		 469 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  49.18 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  40.85 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 139 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 105 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 139 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 470 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 470 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  27.27 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 475 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 139 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.59 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  31.17 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 139 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  24.03 
 
 		 139 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  31.17 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 126 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 454 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 470 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  26.95 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.98 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 120 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.57 
 
 		 486 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54 
 
 		 442 aa  46.2  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7505  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 121 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  38.81 
 
 		 240 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  31.96 
 
 		 241 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 125 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 123 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.38 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 129 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  31.13 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  39.06 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  31.13 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 496 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>