More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3464 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  54.55 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  39.84 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  33.07 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.8 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  34.19 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  39.47 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.9 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  31.78 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  34.21 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.73 
 
 		 478 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 305 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 475 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  30.08 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  32.48 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  28.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  38.67 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  35.16 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  28.24 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  36 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  38.36 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>