More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5551 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  100 
 
 		 322 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.32 
 
 		 336 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.14 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.88 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  39.46 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.89 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.57 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.97 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.12 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.95 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.07 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.62 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  40.91 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.87 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.18 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.72 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.09 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.34 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.6 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.77 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.05 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.4 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.19 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.05 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.02 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.13 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.74 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.86 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5491  extra-cytoplasmic solute receptor  37.93 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.75 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  40.44 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.76 
 
 		 314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.76 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.83 
 
 		 325 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.87 
 
 		 323 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.08 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.59 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.48 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.97 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.66 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.66 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.41 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.2 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.99 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.45 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.07 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  41.04 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.34 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.16 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.59 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.18 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  40.27 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.32 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  38.23 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.31 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.54 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  37.78 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.31 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.04 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  40.48 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  41.22 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.62 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  38.26 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.16 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.49 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  35.5 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.26 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  39.34 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.21 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  39.79 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.38 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.94 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.75 
 
 		 326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  40.07 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.07 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.54 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.73 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.86 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.97 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  40.48 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.38 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.13 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>