More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4337 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 335 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.77 
 
 		 331 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.78 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.45 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 		 328 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.07 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.13 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.82 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.09 
 
 		 330 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.62 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.81 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.9 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  42.57 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.36 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.55 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.47 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  41.46 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.61 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.22 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.33 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.09 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.07 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.67 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.4 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.46 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.58 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 		 358 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.36 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.78 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.87 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.78 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.93 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.8 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.79 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.16 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  39.34 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.16 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.14 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.79 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.91 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.13 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.1 
 
 		 333 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.74 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.2 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.88 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.92 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.4 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  41.16 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.17 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.13 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  38.63 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.67 
 
 		 336 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  42.18 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.53 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.66 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.53 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.31 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.62 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.98 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  38.78 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  41.55 
 
 		 326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37.97 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.36 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.06 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  38.08 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  38.56 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.69 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.26 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.09 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.09 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.2 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.88 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.59 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.88 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.05 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.49 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.8 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.03 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  41.89 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.8 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.14 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>