More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1801 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  42.91 
 
 		 330 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  42.18 
 
 		 329 aa  232  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  42.03 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  40.82 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  39.81 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  39.94 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.38 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  40.48 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  39.74 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.02 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  39.4 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  37.62 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  38.62 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.93 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  39.61 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  40.13 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  38.72 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.07 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.59 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  38.64 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  38.36 
 
 		 330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  36.55 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  38.61 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  34.94 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  37.12 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  36.57 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.84 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  38.38 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  40.2 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  38.3 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  39.41 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.9 
 
 		 333 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  37.21 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  38.83 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.93 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  36.27 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  37.95 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.19 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  34.92 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.79 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.96 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.73 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3854  hypothetical protein  38.03 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.03 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.41 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.42 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.87 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  38.64 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  37.66 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.05 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.23 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.23 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.33 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.46 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.67 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  34.75 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  36.3 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  36.2 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.76 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  36.49 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  33.97 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.61 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.55 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  33.66 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.69 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.24 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  33.77 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  37.25 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.25 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  34.56 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  38.06 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.07 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  34.45 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.1 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  36.69 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  35.55 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  35.93 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3770  hypothetical protein  34.81 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.77 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  35.31 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  35.53 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.37 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.2 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  38.73 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.42 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.2 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.14 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>