235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0972 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  89.04 
 
 		 358 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  83.94 
 
 		 362 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  84.23 
 
 		 362 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 358 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  82.77 
 
 		 358 aa  627  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  75.57 
 
 		 368 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  74.72 
 
 		 368 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  72.52 
 
 		 368 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  71.91 
 
 		 368 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  70.72 
 
 		 361 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  70.79 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  70.79 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  70.79 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  71.79 
 
 		 368 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  70.79 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  70.79 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  70.51 
 
 		 368 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  69.86 
 
 		 361 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  66.39 
 
 		 361 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  70.56 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  69.72 
 
 		 361 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  69.1 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  67.5 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  66.85 
 
 		 362 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  64.67 
 
 		 368 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  65.19 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  55.31 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  56.42 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  56.02 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  55.4 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  57.66 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  53.93 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  54.99 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  57.06 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  54.26 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  53.85 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  51.7 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  54.4 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  51.27 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  55.59 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  53.41 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  52.53 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  52.25 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  53.49 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  50.57 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  51.52 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 344 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 		 356 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 		 344 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  51.5 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  51.5 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  50.75 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  48.55 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  49.11 
 
 		 352 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  48.37 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 343 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  49.1 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  48.31 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 		 342 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  50.66 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.18 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  47.38 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  48.73 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  43.79 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.39 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.5 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.87 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.36 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 338 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.18 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.59 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  43.08 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  37.18 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.66 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.81 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  32.66 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  33.05 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.05 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  36.12 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  39.32 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  39.32 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  39.32 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  34.14 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>