More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0666 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  59.5 
 
 		 331 aa  321  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  57.73 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  57.34 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  55.94 
 
 		 307 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  57.34 
 
 		 302 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  57.75 
 
 		 300 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  57.34 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  54.26 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  57.19 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  56.4 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  48.57 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  47.86 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  47.5 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  43.99 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  42.24 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  36.19 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 290 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  37.13 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  36.13 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  36.13 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  36.03 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  32.58 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  35.45 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  36.06 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  34.36 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  36.76 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  36.03 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  32.22 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  35.36 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  35.66 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  32.01 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.94 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  32.84 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>