More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2206 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
266 aa  540  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
257 aa  271  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
266 aa  244  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  50 
 
 
252 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 
255 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 
255 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 
255 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
255 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  46.56 
 
 
253 aa  233  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  47.37 
 
 
255 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  45.14 
 
 
255 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  44.94 
 
 
253 aa  221  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 
254 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 
254 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 
253 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  45.73 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
254 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
256 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
260 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
257 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
254 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
254 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
258 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
256 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  42.68 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
254 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
257 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
254 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
254 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.94 
 
 
248 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
255 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
256 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
256 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
256 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.18 
 
 
247 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
257 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
255 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
286 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
246 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.65 
 
 
246 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
251 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.2 
 
 
250 aa  178  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
258 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
246 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
246 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
246 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
246 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
246 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.56 
 
 
246 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.77 
 
 
246 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
251 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
255 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.37 
 
 
246 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  40.55 
 
 
261 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
261 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
247 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
246 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.03 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>