99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2012 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.58 
 
 		 863 aa  714    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  53.18 
 
 		 862 aa  727    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  54.65 
 
 		 864 aa  713    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  57.53 
 
 		 760 aa  767    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  57.53 
 
 		 760 aa  767    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 663 aa  1370    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  53.63 
 
 		 864 aa  728    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  52.8 
 
 		 865 aa  706    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  50.37 
 
 		 673 aa  622  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  48.47 
 
 		 647 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  48.36 
 
 		 620 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  47.87 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  45.72 
 
 		 632 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  48.2 
 
 		 620 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  45.77 
 
 		 648 aa  517  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  40.16 
 
 		 658 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  36.54 
 
 		 699 aa  364  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  33.49 
 
 		 628 aa  336  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  34.27 
 
 		 628 aa  336  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  32.04 
 
 		 648 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  31.66 
 
 		 649 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  31.77 
 
 		 639 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  31.87 
 
 		 631 aa  323  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  33.39 
 
 		 617 aa  323  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  34.58 
 
 		 628 aa  323  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  30.99 
 
 		 645 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  30.95 
 
 		 645 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  34.13 
 
 		 646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  34.41 
 
 		 649 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  34.41 
 
 		 649 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  32.33 
 
 		 630 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  31.53 
 
 		 640 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  32.69 
 
 		 638 aa  317  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 636 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  33.17 
 
 		 636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 690 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  34.14 
 
 		 646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  31.72 
 
 		 639 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  33.98 
 
 		 646 aa  310  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  33.08 
 
 		 646 aa  310  8e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  32.99 
 
 		 650 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  31.55 
 
 		 639 aa  308  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  33.04 
 
 		 655 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 693 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  33.82 
 
 		 645 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 691 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 644 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  32.06 
 
 		 647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  32.74 
 
 		 660 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  31.67 
 
 		 644 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  32.9 
 
 		 652 aa  288  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  31.12 
 
 		 652 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  29.2 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  29.2 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  31.11 
 
 		 125 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  36.47 
 
 		 322 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  28.97 
 
 		 262 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 		 124 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  31.87 
 
 		 162 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 168 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  26.47 
 
 		 160 aa  53.9  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 		 300 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.67 
 
 		 316 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  28.23 
 
 		 172 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 125 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 124 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 342 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  28.43 
 
 		 171 aa  48.5  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 		 334 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.7 
 
 		 371 aa  47.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  26.44 
 
 		 177 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 310 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.16 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  40.74 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1090  chain A, red copper protein nitrosocyanin  38.03 
 
 		 140 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.61148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1601  chain A, red copper protein nitrosocyanin  33.8 
 
 		 137 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000567409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  28.89 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.67 
 
 		 351 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 313 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 158 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 314 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 186 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 359 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 279 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>