74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6571 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
633 aa  1273    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  29.17 
 
 
293 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  26.52 
 
 
403 aa  95.1  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
275 aa  94.4  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  26.73 
 
 
540 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 
275 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
278 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.64 
 
 
654 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  25.48 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.42 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.25 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
1316 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  25 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
805 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
850 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
979 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  23.49 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 
615 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 
648 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  29.33 
 
 
322 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 
615 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.66 
 
 
298 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  34.62 
 
 
277 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 
612 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 
841 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 
666 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
265 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 
789 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  29.01 
 
 
369 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  26.27 
 
 
292 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.69 
 
 
343 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 
641 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.37 
 
 
907 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  29.14 
 
 
404 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
711 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
711 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.05 
 
 
469 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.86 
 
 
843 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.42 
 
 
561 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  23.61 
 
 
463 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
612 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  29.34 
 
 
609 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 
717 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  37.18 
 
 
297 aa  54.7  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
302 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  29.14 
 
 
1097 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.34 
 
 
719 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.82 
 
 
562 aa  50.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.87 
 
 
1274 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 
464 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  29.63 
 
 
517 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 
1554 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.76 
 
 
1004 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 
538 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 
709 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.08 
 
 
288 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 
538 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
795 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
795 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.01 
 
 
729 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 
1711 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.84 
 
 
305 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
1196 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.16 
 
 
925 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
278 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.35 
 
 
481 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.02 
 
 
902 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 
871 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  26.45 
 
 
509 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 
590 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 
890 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>