276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5503 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.38 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  41.18 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.94 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.7 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.18 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.71 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.89 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  36.41 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.3 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.13 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.18 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.83 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  40.61 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.29 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.22 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  32.18 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.4 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.46 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  35.59 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.74 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  32 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.27 
 
 		 427 aa  87.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.28 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.46 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.1 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.16 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.95 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  31.19 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  31.43 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  32.28 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  30.73 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.04 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.44 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  34.39 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.03 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.33 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.82 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.57 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.22 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  29.59 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  29.59 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  26.83 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  29.59 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  36.91 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.9 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.65 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.55 
 
 		 437 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.63 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.15 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.66 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  31.43 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  31.75 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.28 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.14 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.43 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.81 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.24 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.65 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.23 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  31.75 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.76 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.78 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.62 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.22 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.14 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  31.46 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.5 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  31.07 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.9 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  27.59 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  28.64 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.35 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  29.29 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  27.67 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.8 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.24 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  28.21 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.76 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  32.04 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  29.56 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.69 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.56 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  27.23 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>