More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2920 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  100 
 
 
363 aa  742    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  92.56 
 
 
363 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  71.87 
 
 
374 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
440 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  55.74 
 
 
329 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  55.27 
 
 
331 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  55.56 
 
 
329 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  51.51 
 
 
367 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  53.74 
 
 
357 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.86 
 
 
325 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  50.96 
 
 
358 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  52.57 
 
 
325 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  52.23 
 
 
372 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  53.59 
 
 
352 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  52.51 
 
 
351 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  51.4 
 
 
333 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
331 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  54 
 
 
325 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  53.35 
 
 
352 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  51.52 
 
 
356 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  46.99 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.82 
 
 
373 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
423 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 
366 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  45.05 
 
 
381 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.54 
 
 
387 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
363 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.74 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.72 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.21 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 
355 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.07 
 
 
382 aa  272  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 
372 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 
384 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.64 
 
 
377 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 
373 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5881  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  50 
 
 
369 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.44 
 
 
399 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 
382 aa  269  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  40.23 
 
 
387 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  43.12 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.39 
 
 
368 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
370 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 
379 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.34 
 
 
354 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.77 
 
 
327 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.6 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  45.74 
 
 
353 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
327 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
327 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
327 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.99 
 
 
352 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
331 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.66 
 
 
358 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
331 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
331 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.44 
 
 
381 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.44 
 
 
364 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.88 
 
 
361 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 
327 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.44 
 
 
364 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 
369 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
327 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
327 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  39.33 
 
 
372 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
366 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
349 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 
343 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
369 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.8 
 
 
383 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  52.08 
 
 
356 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
353 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.84 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 
365 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  41.79 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.9 
 
 
372 aa  262  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.26 
 
 
343 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.35 
 
 
363 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.24 
 
 
374 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
388 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 
388 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.54 
 
 
385 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.06 
 
 
388 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  43.35 
 
 
353 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
367 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 
388 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  38.44 
 
 
374 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 
353 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.12 
 
 
372 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
374 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.21 
 
 
367 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.96 
 
 
373 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  40.69 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
353 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>