More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5514 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  98.06 
 
 
261 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  90.04 
 
 
261 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  82.76 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  79.69 
 
 
261 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  78.16 
 
 
261 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
295 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.96 
 
 
255 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  59.06 
 
 
267 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 
257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  58.5 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.08 
 
 
267 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.43 
 
 
277 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.81 
 
 
278 aa  295  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 
254 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  56.69 
 
 
271 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 
254 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 
274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.38 
 
 
254 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  55.47 
 
 
257 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.42 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.15 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  52.94 
 
 
254 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.08 
 
 
244 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52.99 
 
 
250 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  54.15 
 
 
248 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
240 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.15 
 
 
244 aa  267  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  54.15 
 
 
246 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.17 
 
 
260 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.8 
 
 
257 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.15 
 
 
246 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.99 
 
 
250 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.75 
 
 
255 aa  265  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.98 
 
 
240 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.18 
 
 
240 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.98 
 
 
240 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.18 
 
 
240 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 
257 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.39 
 
 
268 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.96 
 
 
247 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.33 
 
 
245 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.36 
 
 
259 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  54.98 
 
 
244 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
240 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  53.49 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
256 aa  260  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.17 
 
 
240 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
240 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 
254 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  53.23 
 
 
261 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.6 
 
 
247 aa  260  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  52 
 
 
254 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  55.87 
 
 
257 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
254 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.59 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.94 
 
 
259 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.78 
 
 
243 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.59 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.78 
 
 
252 aa  259  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  51.97 
 
 
255 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.56 
 
 
274 aa  258  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  52.17 
 
 
253 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
245 aa  258  9e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 
257 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  51.98 
 
 
250 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.57 
 
 
252 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  52.57 
 
 
247 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
240 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  53.09 
 
 
247 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  52.57 
 
 
247 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  52.23 
 
 
254 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  51.39 
 
 
246 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  53.85 
 
 
254 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  52.19 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.37 
 
 
244 aa  257  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
242 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.78 
 
 
239 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.39 
 
 
244 aa  256  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  50.19 
 
 
265 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  52.78 
 
 
247 aa  255  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  53.33 
 
 
254 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  51.37 
 
 
251 aa  255  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  51.59 
 
 
254 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  51.59 
 
 
254 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  51.39 
 
 
258 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  52.17 
 
 
248 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  52.19 
 
 
241 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>