More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3937 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 589 aa  1179    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.83 
 
 		 584 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.77 
 
 		 583 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.24 
 
 		 586 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.67 
 
 		 552 aa  465  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.92 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.54 
 
 		 537 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.82 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.310324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.78 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.98 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.274613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 		 556 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.63 
 
 		 580 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.49 
 
 		 511 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.39 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 		 573 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.93 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928828 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.9 
 
 		 592 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3864  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 		 554 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 		 605 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.96 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 		 551 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.2 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4047  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 556 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 		 599 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3412  putative methyl-accepting chemotaxis I (serine chemoreceptor) transmembrane protein  68.67 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 		 594 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.08 
 
 		 471 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00689697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.75 
 
 		 532 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4053  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 545 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206976  hitchhiker  0.0000952985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.11 
 
 		 614 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3683  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.97 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.755698  normal  0.0578518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.71 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  62.5 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.36 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.12 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 581 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.84 
 
 		 537 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000862286  decreased coverage  0.00394801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.96 
 
 		 659 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3910  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 555 aa  369  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.5 
 
 		 597 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.87 
 
 		 536 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000611014  hitchhiker  0.00000521325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54 
 
 		 581 aa  364  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 		 618 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.58 
 
 		 653 aa  361  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.16 
 
 		 612 aa  362  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343543  normal  0.663369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.58 
 
 		 653 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  58.26 
 
 		 585 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  55.15 
 
 		 559 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  44.57 
 
 		 562 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.31 
 
 		 642 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.0148687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  62.3 
 
 		 564 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  44.38 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.38 
 
 		 580 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6240  chemotaxis sensory transducer  44.12 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 		 562 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.4 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.89 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448898  normal  0.153923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 		 577 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.88 
 
 		 598 aa  352  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.03 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 		 548 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.74 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 546 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0685  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 526 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 546 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 546 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  63.16 
 
 		 546 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2548  methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 		 525 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00975221  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  44.99 
 
 		 513 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.52 
 
 		 519 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000313766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>