201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1434 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  100 
 
 		 185 aa  390  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  85.41 
 
 		 186 aa  337  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  84.15 
 
 		 185 aa  337  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  85.33 
 
 		 185 aa  335  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  84.86 
 
 		 185 aa  328  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  83.15 
 
 		 185 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  81.08 
 
 		 185 aa  324  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  81.08 
 
 		 185 aa  324  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  74.18 
 
 		 202 aa  294  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  52.97 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  52.97 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  55.19 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  50.27 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  51.1 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  48.09 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  48.63 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  49.18 
 
 		 204 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  50.27 
 
 		 194 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  48.63 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  45.9 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  44.09 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  46.89 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  47.19 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  47.19 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  47.4 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  46.11 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.73 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  45.16 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  37.57 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  34.87 
 
 		 197 aa  87.8  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  47.56 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  52.44 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  38.38 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  40.4 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  38.38 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  38.38 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  45.68 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  41.46 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  32.9 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  46.99 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  46.34 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  36.42 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  45.05 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  43.68 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  49.37 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  45.05 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  43.37 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  43.53 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  45.57 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  46.05 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  44.32 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  47.56 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  33.11 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  43.96 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  33.11 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  42.25 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  46.91 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  43.96 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  46.25 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  46.38 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  43.01 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  46.25 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  45.57 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  42.86 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  46.84 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  44.3 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  30.37 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  46.25 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  32.45 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  32.73 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  36.79 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  46.84 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  45.33 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  29.81 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  29.88 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  29.88 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  31.01 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 139 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  45.12 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  32.5 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  45 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>