More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5785 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  34.33 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.33 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  35.76 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.22 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  44.58 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  36.08 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.09 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  30.41 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>