More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4142 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  70.72 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  66.22 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  54.35 
 
 		 331 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  55.52 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  55.18 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  55.42 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  57.19 
 
 		 349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  52.96 
 
 		 328 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  52.63 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  50.94 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  50.63 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  52.68 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.89 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.97 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.95 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.06 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.32 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.67 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  47.55 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.81 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.8 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.2 
 
 		 318 aa  249  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.46 
 
 		 327 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.64 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  47.58 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.91 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.64 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  49.4 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.74 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.67 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  42.5 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.83 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  44.81 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.84 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  43.3 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.84 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  41.36 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  46.24 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.56 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  45.95 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  44.22 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.94 
 
 		 322 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.26 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.48 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  44.78 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.4 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.4 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.24 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  42.67 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  38.44 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  45.83 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.97 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2507  hypothetical protein  38.63 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00246181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  41.64 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.27 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.61 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.23 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.35 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.07 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.33 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  42.45 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.85 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.14 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.26 
 
 		 698 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  44.55 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.48 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.47 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  42.28 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.66 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  42.25 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  38.75 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  38.75 
 
 		 328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.78 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.79 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  38.72 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.62 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.47 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.28 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.67 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  39.25 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.18 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.19 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.61 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.36 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.61 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.75 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.2 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.31 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  39.8 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>