More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3899 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  72.51 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  59.33 
 
 		 340 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  47.08 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  42.46 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  44.08 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  41.99 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  39.88 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.57 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.92 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.67 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.74 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.74 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  43.11 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.46 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  46.82 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.08 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.41 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  42 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  39.25 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.61 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.61 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.07 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.67 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.96 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.72 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.41 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.53 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.88 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.16 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.29 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.23 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.66 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.37 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.91 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.33 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.45 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.57 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.94 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  37.04 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  37.04 
 
 		 330 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.67 
 
 		 360 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 348 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  43.83 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  44.53 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.47 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  43.82 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.96 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.1 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.81 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.34 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.99 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.99 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  41.33 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.38 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.67 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.97 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  42.95 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.75 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  43.03 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.21 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.21 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.84 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.78 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.21 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  39.45 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  40.18 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  43.19 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  44.57 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.83 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.24 
 
 		 331 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.05 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.86 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.65 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.84 
 
 		 324 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.36 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  41.96 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  38.68 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  41.69 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  40.4 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.98 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40.92 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.7 
 
 		 330 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.56 
 
 		 333 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.03 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  41.37 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  40.35 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.74 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  36.56 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.81 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  40.97 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  39.31 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>