More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3866 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  67.76 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  51.88 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  41 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  35.98 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  38.67 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.43 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 292 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 319 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.99 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 295 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  27.44 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 281 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.36 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.43 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.33 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.05 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.16 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  28.57 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  26.69 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  26.34 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.34 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  23.63 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>