51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4045 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  43.23 
 
 		 963 aa  688    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  44.58 
 
 		 953 aa  794    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  47.66 
 
 		 973 aa  753    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  100 
 
 		 968 aa  1889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  47.51 
 
 		 972 aa  754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  90.81 
 
 		 968 aa  1640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  35.86 
 
 		 948 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  35.69 
 
 		 947 aa  483  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  43.21 
 
 		 842 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.08 
 
 		 397 aa  55.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 847 aa  55.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  41.98 
 
 		 842 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  41.98 
 
 		 842 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1383  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1026 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.980355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  34.67 
 
 		 846 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 1081 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1605  hypothetical protein  24.54 
 
 		 897 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.453763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 873 aa  52.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 834 aa  52  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.54 
 
 		 870 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 		 1169 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 1129 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.87 
 
 		 842 aa  51.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.04 
 
 		 858 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 848 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  39.78 
 
 		 857 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.54 
 
 		 866 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.84 
 
 		 381 aa  49.7  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  39.51 
 
 		 852 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 1101 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 		 847 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.26 
 
 		 845 aa  47.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.08 
 
 		 847 aa  47.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  28.51 
 
 		 464 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  50 
 
 		 859 aa  46.2  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  29.05 
 
 		 858 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 400 aa  46.2  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  27.66 
 
 		 453 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 855 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.67 
 
 		 411 aa  45.8  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  37.08 
 
 		 828 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 838 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  28.5 
 
 		 855 aa  45.8  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.97 
 
 		 410 aa  45.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  40.68 
 
 		 861 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  26.75 
 
 		 430 aa  45.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  36.71 
 
 		 885 aa  45.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  38.32 
 
 		 878 aa  44.7  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.95 
 
 		 414 aa  44.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 849 aa  44.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>