More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2703 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  100 
 
 		 866 aa  1735    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  53.9 
 
 		 835 aa  853    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  49.77 
 
 		 829 aa  747    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  78.43 
 
 		 868 aa  1348    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  42.3 
 
 		 815 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  41.91 
 
 		 815 aa  630  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  42.32 
 
 		 815 aa  611  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  36.81 
 
 		 802 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  36.63 
 
 		 802 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  36.63 
 
 		 802 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.23 
 
 		 804 aa  532  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 801 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  42.18 
 
 		 732 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  45.5 
 
 		 732 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  34.54 
 
 		 801 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  37.64 
 
 		 809 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.05 
 
 		 801 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  34.54 
 
 		 801 aa  512  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  35.05 
 
 		 801 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.74 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  34.74 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  34.74 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.74 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  34.74 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  34.9 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  41.02 
 
 		 745 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  34.75 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  42.93 
 
 		 747 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.92 
 
 		 815 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  37.02 
 
 		 848 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.96 
 
 		 818 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  40.55 
 
 		 749 aa  490  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  44.03 
 
 		 752 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  37.22 
 
 		 825 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  35.43 
 
 		 796 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  36.39 
 
 		 849 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  43.57 
 
 		 752 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  36.51 
 
 		 775 aa  482  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  39.75 
 
 		 828 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  44.32 
 
 		 735 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  36.59 
 
 		 914 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  34.12 
 
 		 798 aa  479  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.71 
 
 		 781 aa  474  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  37.25 
 
 		 835 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  36.07 
 
 		 803 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  37.02 
 
 		 843 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  35.3 
 
 		 802 aa  469  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  45.33 
 
 		 730 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  44.08 
 
 		 758 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  44.01 
 
 		 754 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  40.73 
 
 		 731 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.96 
 
 		 731 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  40.52 
 
 		 798 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  39.93 
 
 		 821 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  40.78 
 
 		 746 aa  452  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  40.03 
 
 		 724 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  40.35 
 
 		 786 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  32.47 
 
 		 803 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  38.92 
 
 		 836 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  43.86 
 
 		 770 aa  445  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  38.48 
 
 		 858 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  35.01 
 
 		 810 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  44.88 
 
 		 744 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  33.46 
 
 		 790 aa  439  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  36.24 
 
 		 815 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  37.51 
 
 		 806 aa  439  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  39.59 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  35.16 
 
 		 811 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  42.44 
 
 		 732 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  40.46 
 
 		 751 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  40.19 
 
 		 738 aa  430  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  38.53 
 
 		 814 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  41.52 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  35.44 
 
 		 813 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.33 
 
 		 768 aa  426  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  37.87 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  47.91 
 
 		 805 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  43.72 
 
 		 679 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  35.81 
 
 		 812 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  41.08 
 
 		 792 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  35.36 
 
 		 812 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  31.95 
 
 		 831 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  38.99 
 
 		 735 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  40.15 
 
 		 780 aa  416  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  44.99 
 
 		 738 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  33.17 
 
 		 815 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  35.05 
 
 		 810 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  34.47 
 
 		 804 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  38.24 
 
 		 745 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  33.33 
 
 		 815 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  38.64 
 
 		 660 aa  399  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  32.37 
 
 		 832 aa  397  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  46.69 
 
 		 736 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  32.65 
 
 		 824 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  39.29 
 
 		 749 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  45.77 
 
 		 736 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  45.4 
 
 		 736 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  35.91 
 
 		 715 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1677  primosomal protein n  41.41 
 
 		 755 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04971  primosomal protein N' (replication factor Y)  41.44 
 
 		 753 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>