More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1299 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1299  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  668    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  92.19 
 
 		 338 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  44.21 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0344  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 432 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 364 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  35.33 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.05 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.33 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  25.47 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.02 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 		 435 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  27.88 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.33 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  30.77 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  31.29 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.15 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.38 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  28.99 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  22.86 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  33.68 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 468 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 412 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.4 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.79 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.17 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  30.3 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  32.03 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  32.2 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  22.96 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.76 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>