104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0136 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 261 aa  526  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  89.66 
 
 		 261 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  72.16 
 
 		 260 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  26.46 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  31.23 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.34 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  27.02 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  27.42 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  27.13 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.13 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  27.13 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  29.53 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.75 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  26.23 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  25.77 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  30.42 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.78 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  24.29 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  25.76 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  25.25 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  30.04 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  25.25 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  24.75 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  24.75 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  24.75 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  24.75 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  30.88 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.59 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  25.86 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  27.95 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  23.35 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  31.61 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  27.36 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  28.78 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.69 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  25.35 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  24.02 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  23.92 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  25.67 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  30.12 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 358 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  23.68 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  36.23 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.95 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  35.51 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  27.47 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  37.97 
 
 		 119 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  29.33 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  43.86 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  28.95 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  24.7 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 344 aa  48.9  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  28.74 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  32.74 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  30.65 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  27.71 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  35 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  25.9 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  26.14 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  30.54 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 354 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  40.62 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  27.41 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4640  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>