159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1814 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0461  hypothetical protein  99.15 
 
 		 117 aa  226  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0472  hypothetical protein  85.47 
 
 		 117 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  56.52 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  52.21 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  49.49 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  41.44 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  36.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  39.18 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  36.08 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  30.91 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  31.19 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  31.19 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  28.81 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  29.91 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  34.21 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  31.93 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  37.63 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  37.11 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  36.84 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  36.08 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  32.63 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  35.78 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.79 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  35.96 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  29.46 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  35.64 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  42.59 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  39.76 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  32.48 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.52 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  32.35 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  32.46 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.96 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  38.67 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  34.02 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  27.52 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  28.32 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  34.51 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  27.72 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  33.94 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  27.03 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.07 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  31.78 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  31 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  33.91 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  30.09 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  32.63 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  26.76 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  31.63 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  28.17 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  29.59 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  33.88 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  32.35 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.75 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  28.07 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  28.17 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  43.66 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  35.45 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  30.16 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  30.16 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  31.48 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  37.35 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  31.48 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  37.35 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  37.35 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  35.48 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  32.47 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  38.27 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  30.43 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>